Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cspp1B2RX88 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cspp1B2RX88 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms