Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Spocd1B1ASB6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms