Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox1B1APN4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms