Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem238A9JSM3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms