Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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