Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms