Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
USP35Q9P2H5 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms