Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Q1T7F1 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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