Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMCO1Q147U7 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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