Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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