Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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