Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CHD3Q12873 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHD3Q12873 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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