Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms