Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ANKRD28O15084 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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