Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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