Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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