Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms