Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms