Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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