Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HMGN3Q15651 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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