Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CNGB1Q14028 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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