Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ITGA9Q13797 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms