Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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