Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
RPS29P62273 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
RPS29P62273 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RPS29P62273 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPS29P62273 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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