Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CENPFP49454 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CENPFP49454 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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