Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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