Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms