Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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