Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PUM3Q15397 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms