Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms