Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRDP23468 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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