Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.3 ms