Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms