Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MAP1LC3CQ9BXW4 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MAP1LC3CQ9BXW4 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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