Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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