Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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SYCP1Q15431 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SYCP1Q15431 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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