Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NEUROD1Q13562 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NEUROD1Q13562 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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