Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TCOF1Q13428 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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