Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms