Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms