Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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