Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CHD3Q12873 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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CHD3Q12873 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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CHD3Q12873 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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CHD3Q12873 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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