Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms