Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTCH1Q13635 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms