Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms