Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CHAF1AQ13111 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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