Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms