Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRDP23468 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms