Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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TDP1Q9NUW8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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