Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GTF3C6Q969F1 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms